Chongli genombrott! AI-fyllning av proteinkvalitetsberäkning en stor blankett, eller mysteriet med cancer, demens och sjukdom?

förord

Epidemin, demens och andra mystiska sjukdomar är den främsta orsaken till den dödliga sjukdomen, och sjukdomens inverkan på världens största befolkning, som är en av de tre största populationerna i världen. Bland dem är degenerativa sjukdomar främst kroniska höginkomstsjukdomar, som är viktigare för en persons hälsa och livskvalitet.

Fördjupad förståelse för proteinkvalitet, struktur och funktionsmetod, i framtiden har vi beslutat att ge viktig vård för mindre sjukdomar. Tidigt på 1950-talet började forskning om problemet med proteinkvalitetsdefekter. Med tillkomsten av AlphaFold har forskare och forskare gjort en stor förändring i kvaliteten på sina forskningsproteiner.

Nu har AI för proteinvetenskap fått ett nytt genombrott.

Inom en snar framtid kommer jag att arbeta på Hong Kong University, University of Tokyo Children's Research Hospital och forskargruppen vid University of Science and Technology. Universell aritmetik för specifika strukturella egenskaper hos proteinegenskaper, forskning om proteinegenskaper har nått området för intrinsically orderless proteins (IDP).

IDP: er är de tre viktigaste strukturella proteinegenskaperna som kan bestämmas utan någon juridisk kompromiss, och de viktiga biologiska betydelserna som måste erkännas i hälsosystemet såväl som i patofysiologin för olika sjukdomar. På grund av variationen i proteinkvalitet är egenskaperna hos IDP: er hög grad av frihet, lokal rörlighet och hög rörlighet, vilket för närvarande är mycket utmanande.

Denna studie krävde inte att den befintliga teorin lämnades in, och den nya designmetoden lämnades in, och IDP:erna ändrades, och utrustningen som användes studerades och modellen introducerades. IDPs Som en uppsättning attribut tillhandahåller vi nya verktyg för att beräkna proteinkvalitet, och vi förstår att det finns många typer av degenerativa sjukdomar. sjukdom, Kanamori-sjukdom, hudatrofi och skleros), sjukdomsmekanismen för olika typer av cancersjukdomar och utvecklingen av nya biomaterial.

Companion research review "Design av i sig störda proteinvarianter med olika strukturella egenskaper" i Science Advances.

Var köper jag IDP?

När påbudet har lämnats in har den specifika metoden tillämpats på det nya öst och väst. Efter den exakta översättningen av den vikta versionen kommer du att kunna skapa en ny pappersprodukt i framtiden. Samma papper skrevs, förändringen ändrades, förändringen fullbordades och flygningen var klar och elefanten erövrade flygningen.

Under lång tid kan själva syramolekylen brytas ner till en specifik form och har ingen funktion. Som en allmän tumregel har små molekyler länge använts i produktionen av proteiner. En uppsättning instruktioner för att välja det basiska syraselektions-DNA:t. Efter att ha skapats omvandlas den slutliga 3D-formen av proteinet till en momentan, flerdimensionell precisionskurva och den slutliga 3D-formen av proteinet.

Som ett resultat är kvaliteten på proteinet inte bra, så den höga effektiviteten är klar, och framstegsprocessen i människokroppen är en serie misslyckanden. Biotoxicitet som leder till dödsfall på grund av utvecklingen av proteinegenskaper som kan uppstå om reaktionen inträffar. Många sjukdomar och funktionsnedsättningar, många fall av cellulär funktionsnedsättning, som orsakas av proteinkvalitet. Om proteinets proteinkvalitet ändras är det möjligt att sätta ihop gruppen, och detta är ett tecken på en degenerativ sjukdom som 阿尔茨海默病和帕Kanamori-sjukdomen.

Därför är det mycket viktigt att vi förstår den molekylära 3D-formen av proteiner och behandlar degenerativa sjukdomar.

Men när området för strukturbiologi har kommit till sin frukt har forskningen fokuserat på att utveckla 3D-strukturella proteinegenskaper och nukleinsyror, och för närvarande finns det många grundläggande förståelser av funktionaliteterna i systemet "ordning-struktur-funktionalitet".

Därför är proteinkvaliteten hos eukaryoter cirka 30 %, och proteinkvaliteten i 3D-strukturen är fixerad, så det finns en liten förändring i proteinkvaliteten. IDPs, även kallade "inneboende störda områden" (IDR), i samband med andra strukturerade proteinegenskaper. IDP:er och IDR:er De olika viktiga aspekterna av varje typ av prestanda i systemets molekylära system, struktur och funktion.

IDPs En kombination av olika degenerativa sjukdomar (såsom atrofi av huden, atrofi av huden och atrofi av huden) och en kombination av flera cancerformer och funktionsnedsättningar. De molekylära aggregaten av levande organismer finns i den cellulära miljön, och det finns många typer av membranlösa cellulära organförmågor, som är mycket viktiga egenskaper i cellulär biologi och sjukdomar.

För att ytterligare förstå fältet biologi och mänskliga sjukdomar har Paul Robustelli, docent vid Special School of Science, för närvarande en ömsesidig förståelse för världens utmaningar: "Construction Biology Requires Transcendental Research Tools Defined 3D Som ett resultat av forskning om strukturella proteinegenskaper, hur bestämmer vi ordningen för IDRs, formen i funktionen, formfördelningen av strukturen och funktionsfördelningen i funktionen och funktionen?

Framtida beräkning av proteinkvalitetsutveckling IDP:er

IDP:er har inga begränsningar, men har vanligtvis icke-justerbara strukturella skillnader, är omöjliga att formulera strukturellt specifika strukturella strukturer och är därför begränsade i sina strukturella egenskaper.

Här har Francesco Pesce bestämt sig för att lösa problemet. På basis av beräkningsmodellen för CALVADOS, som för närvarande är känd som en beräkningsmodell, har andra beräkningar utformats för att användas vid produktion av alla typer av internflyktingar. Observera att A1-LCD:s IDP:er är samma som A1-LCD-modellen.

Andra har utformat ett generellt aritmetiskt system för specifika strukturella egenskaper och proteinegenskaper. Beräkningsmetod kan användas för grovkorniga simuleringar och fria beräkningar, som kan användas som en kombination av speciella mönster och metoder, för att söka framsteg i sekvensens rum, och för att skapa en specifik proteinkvalitetshierarki med en objektiv struktur. Forskarna använde beräkningsmetoden för att designa många typer av proteinmodifieringskroppar, och resultatet uttrycktes som ett resultat av att beräkningsmetoden hade förmågan att designa olika densitet, lång interaktion, fasseparation och proteinmodifieringskropp.

Eftersom beräkningsmetoden går igenom sökorderutrymmet använder den en mycket effektiv grovkornig modell för varje order givet dess struktur och kvalitetssystem. Använd CALVADOS som en grovkornig molekyldynamikmodell (MD) och generera IDP:er som en uppsättning strukturer. Math Society Använd Meng Special Card Calculation Method (MCMC) för att lösa problemordningsutrymmet och dess strukturegenskaper (vanligtvis MD-modell och beräkningsfri förmåga). I den allmänna förbättringsprocessen fastställdes det specifika bassyraarrangemanget, och det specifika målet skulle organiseras som en speciell expedition.

图 | Forskargruppen har utformat en översikt över den hierarkiska aritmetiken för internflyktingar.

Det är möjligt att beräkna internflyktingar med specifika strukturella egenskaper, såsom detaljgrad, långvarig kontakt och separationstendens. Dessutom är det möjligt att utforska sökhierarkin, och det finns en ny och speciell IDP-hierarki. Forskarskolan använder utrustning för att studera modellaccelerationsalgoritmer och dess effektivitet.

I framtiden, när forskargruppen är konstruerad, kommer sökorderutrymmet att ändras och prospekteringsorderutrymmet kommer att ändras. Dessutom är författarens föreslagna utrustningsstudier särskilt viktiga när det gäller mätning, som kan förbättras, och effektiviteten kan beräknas genom kemiska beräkningar. Utöver detta kan beräkningsmetoden användas för att utforma en specifik hierarki, och möjligheten att kontakta en specifik hierarki är också möjlig.

AI för proteiner, en direkt promenad

På 1960-talet började forskare forska om proteinegenskaper och vid den tiden utvecklades och analyserades huvudteknologierna som röntgenstrålning och kärnmagnetisk resonans (NMR). Som ett resultat av den snabba utvecklingen av beräkningstekniken har forskare utvecklat en ny beräkningsmetod som har lett till utvecklingen av proteinkvalitet.

År 2016 föreslog författaren precisionen av kontaktanalys av proteinkvalitetsrester med hjälp av ResNet. Baserat på de tidigare resultaten, en serie kombinationer av kombinationer och djupinlärning och matematisk forskningsfas, till exempel AlphaFold (sidovikt distansförlängning) och David Bakers expansion. trRosetta (sidan Chongyu introduktion dubbelsidig vinkel information, etc.), enhetligt ifyllda ResNet ramverk.

2020 var AlphaFold2 i CASP14 och nådde 98,5 % framgång. 2021 har David Bakers företag Science utvecklat ett testverktyg för proteinkvalitet RoseTTAFold, som använder teknik för naturlig språkbehandling (NLP), direktimporterar multi-sekvensanalys (MSA) och ger information om hur man analyserar proteinkvaliteten, vilket möjliggör CASP14-noggrannhet. AlphaFold2 Aimemi. Här är den grundläggande proteinkvalitetssekvensmodellen, även känd som proteinspråkmodellen (PLM), utgångsmaterialet för proteinkvalitetssekvensmodellen.

I slutet av 2022 kommer Meta Company att lansera ESM-2 och ESMFold, den kraftfullaste och mest kraftfulla proteinspråksmodellen i världen vid denna tid. 2024 introducerade David Baker RoseTTAFold All-Atom (RFAA), en ny typ av strukturell utvecklingsmetod, som kan exakt avbilda atomära 3D-molekyler i biologiska system, omfattande proteinegenskaper, nukleinsyror, små molekyler och metallurgisk kemisk modifiering.

Exklusive aktuella framsteg inom proteinkvalitetsforskning, artificiell intelligens (AI) och andra flervägsfunktioner inom proteinkvalitetsforskning, proteinkvalitet och andra biomolekylära interaktioner, proteindesign, proteinkvalitetsforskning, etc. Att se framåt mot framtiden, utöka omfattningen av AI-teknologi och dess inverkan, fylla i tomrummen inom proteinkvalitetsforskningsområdet.